Tuy nhiên, sự phát triển còn mang tính tự phát, thiếu quy hoạch tổng thể và chính sách hỗ trợ cụ thể từ chính quyền. Các khó khăn bao gồm: thiếu nguồn vốn đầu tư ban đầu, kinh nghiệm tổ chức hoạt động giáo dục, nguồn nhân lực có chuyên môn kết hợp
Chất thải nhựa: Cốc, ống hút, túi nilon... từ trà sữa là nguyên nhân gây ô nhiễm môi trường nghiêm trọng.Việc tiêu thụ quá nhiều đường dễ dẫn đến béo phì, tiểu đường type 2, bệnh tim mạch và rối loạn chuyển hóa. Ngoài ra, một số sản phẩm trà sữa sử